Entwicklung neuartiger Methoden zur Kartierung der Mikroumgebung von Tumoren

1 PostDoc in Bioinformatics/Imaging Mass Spectrometry

20.01.2025, Wissenschaftliches Personal

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Die Professur für Analytische Chemie der TUM School of Natural Sciences sucht für Q2/Q3 2025 eine/n Postdoc (Vollzeit/Teilzeit) zur Unterstützung unserer Metabolomics- und Spatial Metabolomics-Arbeiten mit Schwerpunkt auf der Integration verschiedener Datenmodalitäten und der Unterstützung unserer allgemeinen MS-Pipelines. Die Stelle ist derzeit auf 2 Jahre befristet.

Ihre Aufgaben:

• Entwicklung von Algorithmen, die die Integration von MS-Bildgebungsdaten mit anderen Bildgebungsmodalitäten ermöglichen, Durchführung von Gewebe- und Zellsegmentierung, bildgebungsbasierte Einzelzellmetabolomik
• Optimierung von Methoden zur Vorverarbeitung von Bildgebungsdaten für instrumentelle Plattformen
• Arbeit an der Integration von LC-MS/MS abgeleiteten Metaboliten-Annotationen in MS-Bildgebungs-Workflows
• Multivariate Statistik (einschließlich maschinelles Lernen, neuronale Netze usw.) zur Analyse von Metabolomics-Daten

Ihr Profil: Wir suchen eine(n) engagierte(n), zuverlässige(n), proaktive(n) und motivierte(n) Bewerber(in) mit einem hohen Maß an Organisationstalent und Liebe zum Detail, der/die Spaß an selbstständiger, interdisziplinärer Arbeit hat. Von Ihnen wird erwartet, dass Sie sich aktiv in unsere Gruppe einbringen und sich innerhalb der von Ihnen bearbeiteten Projekte und darüber hinaus austauschen. Sie werden Teil einer internationalen Gruppe von 6 Doktoranden und 1 Postdoc sein, die sowohl an eigenen Projekten als auch an Kollaborationsprojekten arbeiten. Außerdem werden Sie in der Gruppe auf weitere Studenten treffen, die sic nur für einige Wochen in unserer Gruppe befinden. Es wird von Ihnen erwartet, dass Sie an den von unserer Gruppe organisierten Lehrveranstaltungen und Laborpraktika auf MSc-Ebene teilnehmen sowie BSc- und MSc-Studenten betreuen und Laborpraktika absolvieren. Es wird erwartet, dass Sie Doktoranden in der Gruppe in Statistik und guter bioinformatischer Praxis schulen. Gute Englischkenntnisse (Schreiben, Sprechen und Hören) sind erforderlich.

Vorraussetzungen:

• MSc oder gleichwertiger Abschluss in einem naturwissenschaftlichen oder verwandten Fach (Informatik, Medizin, Immunologie)
• Abgeschlossenes Doktorat in Bioinformatik
• Erfahrung mit multivariaten statistischen Methoden, neuronalen Netzen, Kodierung
• Erfahrung mit bildgebenden Verfahren (idealerweise Massenspektrometrie) und/oder Metabolomics-Daten
• Grundkenntnisse in Chemie und Physik, Interesse an biomedizinischen Anwendungen der MS

Wir bieten:

• Einbindung in ein dynamisches, internationales und multidisziplinäres Arbeitsumfeld mit verschiedenen nationalen und internationalen Kooperationen, die sich mit ambienter Massenspektrometrie und deren Anwendungen in den Lebenswissenschaften beschäftigen
• Eine konstruktive, lebendige Arbeitsatmosphäre
• Eine Beschäftigung mit angemessener Vergütung: 100% TV-L E13 für Postdocs für die Dauer von 2 Jahren; Teilzeitbeschäftigung ist möglich, mit entsprechender Vertragsverlängerung
• Möglichkeiten zur Präsentation Ihrer Ergebnisse auf nationalen und internationalen Tagungen

Bewerbungsanleitung: Bitte senden Sie Ihre Bewerbung mit einem Motivationsschreiben, einer kurzen Beschreibung Ihrer Forschungserfahrung (mit Hinweis auf Ihre einschlägige Erfahrung), einem Lebenslauf und den Kontaktdaten von zwei Referenzen als eine einzige pdf-Datei (nachname_vorname.pdf) an Prof. Dr. Nicole Strittmatter (Nicole.strittmatter@tum.de). Die Bewerbungsfrist endet am 28. Februar 2025. Bei Fragen steht Ihnen Prof. Strittmatter gerne zur Verfügung.
If skills are comparable to other applicants, disabled candidates will be treated preferentially.

Kontaktinformationen:
Professur für Analytische Chemie
Prof. Dr. Nicole Strittmatter
Technische Universität München
School of Natural Sciences
Lichtenbergstr. 4
85748 Garching
https://www.bio.nat.tum.de/ach/home/

Kontakt: Nicole.strittmatter@tum.de

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