Mikrobielle Lebensgemeinschaften (Mikrobiota) im Verdauungstrakt von Tieren besitzen eine zentrale Rolle zur Aufrechterhaltung der Stoffwechselleistung und des Gesundheitszustandes. Ein verbessertes Verständnis über die Struktur und Funktion der Mikrobiota ist somit unumgänglich. Die Fütterung der Tiere und die zur Verfügung gestellten Nährstoffe beeinflussen die Mikrobiota wesentlich. Eine mögliche Veränderung der Mikrobiota hat Auswirkungen auf die Interaktion der Mikroorganismen untereinander, sowie zwischen Mikroorganismen und dem Wirtstier und somit auf die effiziente Stoffumsetzung im Tier.