Das Mikrobiom, das mit Pflanzen assoziiert ist, wird seit einiger Zeit als "zweites Genom der Pflanzen" bezeichnet, da ein Wachstum von Pflanzen ohne diese Mikroorganismen praktisch unmöglich ist. Nährstoffmobilisierung, Schutz vor Pathogenen und eine verminderte Anfälligkeit gegenüber abiotischen Stressoren sind nur einige wichtige Funktionen, die von Mikroorganismen übernommen werden und die essentiell sind für Pflanzenwachstum und –gesundheit. Ein Großteil der entsprechenden Mikroorganismen, vor allem solcher, die im Wurzelraum der Pflanze leben, werden gezielt durch Exsudate der Pflanze aus dem Bodenmikrobiom rekrutiert und in Ihrer Aktivität gefördert. In einigen Fällen können aber auch humanpathogene Mikroorganismen im Wurzelraum angereichert werden. In dem Vortrag werden Interaktionen zwischen Bodenmikrobiom und Mikroflora der Rhizosphäre gezeigt und die Rolle der Pflanze diskutiert.