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PostDoc Position: Innovative Computational Methods for the Joint Analysis of Single-Cell & Spatial Omics Data (m/f/d)
The Big Data in BioMedicine Group at the Chair of Experimental Bioinformatics (School of Life Sciences, Technical University of Munich (TUM)) invites applications for a postdoctoral position for the development of innovative algorithms for the joint analysis of single-cell & spatial transcriptomic data in the framework of the Novo Nordisk funded collaborative data science grant “MOPITAS” - Multi-omics profiling in time and space. The position is available for up to 4 years. Project: The role of cells in the tissue is largely defined by their differential gene expression, which unfolds both in space and in time. The methods recording this structural information, known as Spatial Transcriptomics (ST) suffer from low transcriptomic resolution, and are prohibitively expensive to perform at scale. Conversely, single-cell RNA sequencing is a mature, cost-effective technology that captures more RNA transcripts and identifies individual cells adequately. This transformative project seeks to bridge the gap between ST and scRNA-seq and to incorporate information on gene-regulatory activity via scATAC-seq. We will utilize novel and innovative algorithms based on a complex interplay of deep neural networks. The focus of TUM in this collaborative project will be to develop new computational methods and software tools to decipher location-specific gene-regulatory mechanisms, with the aim of unraveling how tissues form and change over time and space. Environment: The successful candidate will be part of a strong international consortium (University of Southern Denmark, Copenhagen University, EMBL, TUM) which covers a broad range of expertise ranging from data-science driven wet-lab experimentation to cutting-edge algorithm development. It is envisioned that the involved researchers are actively visiting the connected labs and foster international exchange. TUM is one of the most highly ranked academic institutions in Germany. Within TUM, the candidate will be embedded in a young and dynamic research group (https://biomedical-big-data.de/) located at the School of Life Sciences in Freising. The candidate will benefit from a stimulating research environment that covers many aspects of systems biology ranging from studying gene-regulatory mechanisms to drug repurposing. The candidate will have access to state-of-the-art computing facilities for bioinformatics data processing and machine learning. Requirements: We are seeking outstanding candidates with a PhD in Computer Science, Bioinformatics, Molecular Biology or similar, with strong analytical and problem-solving skills, who are strong in written and oral communication (in English) and have experience in bioinformatics method development and analysis of single-cell sequencing and spatial transcriptomics data. Extensive knowledge of and practical skills in statistical analysis, data mining, data integration, machine learning and programming in R or python are a plus. Application process: Applicants should send a dossier containing a motivational statement (max. one page), a curriculum vitae summarizing qualifications and experience, a list of publications, a certified copy of a PhD degree certificate, names and the email addresses of at least one referee as a single PDF document to Markus List (via e-mail to markus.list [at]tum.de). Online interviews will be conducted with selected candidates and remaining shortlisted candidates may be invited to the TUM campus in Freising, Germany, for face-to-face meetings with the group. The deadline for applications is March 10th, 2023. Data Protection Information: When you apply for a position with the Technical University of Munich (TUM), you are submitting personal information. With regard to personal information, please take note of the Datenschutzhinweise gemäß Art. 13 Datenschutz-Grundverordnung (DSGVO) zur Erhebung und Verarbeitung von personenbezogenen Daten im Rahmen Ihrer Bewerbung. (data protection information on collecting and processing personal data contained in your application in accordance with Art. 13 of the General Data Protection Regulation (GDPR)). By submitting your application, you confirm that you have acknowledged the above data protection information of TUM. Equal opportunity: The Technical University of Munich is an equal opportunity employer. As such, applications from women are explicitly encouraged. Preference will be given to candidates with disabilities who have essentially the same qualifications.
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Nachricht | 17.02.2023 | |
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Experimentelle medizinische Doktorarbeit – MCFC
Das MRI Chronische Fatigue Centrum (MCFC) für junge Menschen der Poliklinik für Kinder- und Jugendmedizin des Klinikums rechts der Isar der Technischen Universität München vergibt ab sofort eine Experimentelle medizinische Doktorarbeit.
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Nachricht | 20.02.2023 | |
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Ingenieur als Bauherrenvertretung in Garching (m/w/d) (unbefristet, in Vollzeit)
Als Teil der Zentralen Verwaltung der TUM sorgt die Zentralabteilung 4 - Immobilien an allen Standorten der TUM als Dienstleister dafür, den Wissenschaftler:innen und Studierenden aus aller Welt die bestmögliche Infrastruktur für Forschung und Lehre bereitzustellen, zu erhalten und an sich verändernde Rahmenbedingungen anzupassen. Zur Verstärkung unseres Teams im Baumanagement suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt bis zu zwei
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Nachricht | 20.02.2023 | |
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Scientist / Post-doctoral Fellow for Ultrasound/Optoacoustic Imaging and Microscopy (m/f)
We are now looking for a qualified and highly motivated Scientist / Post-doctoral Fellow to lead a novel high innovative project on ultrasound and optoacoustic imaging based on a new strategic collaboration with Carl Zeiss AG and iThera Medical GmbH. This proposal is expected to generate a next generation imaging system with significant impact in the biological sciences and in medicine.
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Nachricht | 12.04.2013 | |
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Doktorarbeit über einen Orientierungsstudiengang der Chemie
Tätigkeitsmerkmale: • Ausarbeitung eines Konzepts zur Durchführung eines zweisemestrigen mathematisch-ingenieurwissenschaftlichen Orientierungsstudiengangs Technikum am Standort Garching • Abgleich des Studiengangs Chemie mit den gegenwärtigen Kenntnissen eines Abiturienten und den Kenntniserfordernissen von promovierten Chemikern während der ersten Jahre der Berufstätigkeit. Dadurch sollen Optimierungsmöglichkeiten des Studiengangs Chemie eruiert werden.
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Nachricht | 26.04.2013 | |
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Winterwanderung Kloster Andechs
Datum / date: 21.01.12 Treffpunkt / meeting point: wird per E-Mail bekannt gegeben / will be sent to you via email Uhrzeit / time: 10:45 Uhr Kosten / costs: 5 € Max. Teilnehmerzahl / max number of participants: 40 Anmeldung / registration: Online mit Bezahlung im TUMi Büro/online with payment in TUMi office Tutoren / tutors: Jonas, Benjamin, Alexander B., Rebecca
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Termin | 14.01.2012 | |
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Die Stellen sind bereits vergeben
Die Stellen sind bereits vergeben
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Nachricht | 25.10.2011 | |
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Studentische Hilfskraft für das Study and Teaching Maschinenwesen der School of Engineering and Design (Standort Garching) gesucht
Sie suchen einen Job als studentische Hilfskraft, den Sie gut mit Ihrem Studium am TUM-Standort Garching verbinden können? Der Bereich Study and Teaching Maschinenwesen sucht zum 01.10.22 (oder später) eine Hilfskraft im Umfang von 7 h/Woche.
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Nachricht | 09.09.2022 | |
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Student Assistant (m/f/o) (Administration/Social Media) for the Professorship of Family Business Culture and Ownership, Prof. Dr. Melanie Richards
Student Assistant (m/f/o) (Administration/Social Media) for the Professorship of Family Business Culture and Ownership, Prof. Dr. Melanie Richards
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Nachricht | 15.06.2023 | |
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Praktikum
Am Zentrum für internationale Bildungsvergleichsstudien (ZIB) e.V. der TUM School of Social Sciences and Technology suchen wir für das PISA National Center zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Studierende für ein Praktikum (m/w/d)
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Nachricht | 18.07.2024 | |
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Volljuristinnen/Volljuristen (m/w/d)
Das Hochschulreferat Studium und Lehre – Rechtsangelegenheiten der Technischen Universität München sucht für den Rechtsbereich Studium und Lehre ab dem 01.10.2019 befristet auf zwei Jahre motivierte und engagierte Volljuristinnen/Volljuristen (m/w/d) in Voll- oder Teilzeittätigkeit für 1,5 Stellenäquivalente.
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Nachricht | 08.08.2019 | |
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Die zwei Welten der Bildung
Saudi-Arabien baut eine Uni, Deutschland baut Unterricht ab - wie die Republik auf dem Weg ist, die Zukunft zu verlieren. Beitrag in der Süddeutschen Zeitung vom 19. November 2008
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Archiv-Ordner | 10.12.2008 | |
| SW Developer for Bug Detection Tools | Nachricht | 22.04.2014 | |
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Verwaltungsleiter/in (m/w/d) in Vollzeitbeschäftigung
Der Zentrale Hochschulsport (ZHS) ist die größte Hochschulsporteinrichtung Deutschlands und bietet ein breites Sommer- und Wintersportangebot für Studierende und Hochschulmitarbeitende in München, Freising und Landshut.
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Nachricht | 23.12.2022 | |
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BAföG-Antrag jetzt online stellen
Ab dem Sommersemester 2010 können Studierende in Bayern ihr BAföG unter www.bafoeg-bayern.de online beantragen. Bayern ist damit bundesweit das erste Land, das diese Möglichkeit flächendeckend anbietet.
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Nachricht | 24.03.2010 | |
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Master's Thesis opportunity about "Multi-Plane Cardiac View Synthesis for Cardiac MRI"
This work leverages generative AI to synthesize standard cardiac MRI views (e.g., 4-chamber, short-axis) from routine localizers. Although low in quality, localizers provide comprehensive 3D heart coverage. The goal is to enable view synthesis and plane interpolation to aid scan planning, diagnosis, and efficient cardiac imaging.
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Nachricht | 27.11.2025 | |
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Studentisch Hilfskraft für Mitarbeit an Forschungsprojekt | Professur Entwerfen & Holzbau
Unterstützung beim Forschungsprojekt BIMwood, ab 01. April 2021 für 7,5h/ Woche
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Nachricht | 11.01.2021 | |
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Fachkraft für das Sekretariat
Der Stiftungslehrstuhl für energieeffizientes und nachhaltiges Planen und Bauen, Fakultät für Bauingenieur- und Vermessungswesen / Fakultät für Architektur sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt, spätestens zum 01.12.2010 eine Fachkraft für das Sekretariat
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Nachricht | 05.08.2010 | |
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Ingenieur (M.SC. oder Dipl.Ing.) (m/w/d)
Die Technische Universität München betreibt mit der Forschungs-Neutronenquelle Heinz Maier-Leibnitz (FRM II) in Garching bei München eine der leistungsfähigsten und modernsten Neutronenquellen weltweit. Als Serviceeinrichtung für die Wissenschaft und Dienstleister für die Industrie nehmen wir eine Spitzenstellung im Bereich der Forschung mit Neutronen und deren technischer Nutzung ein. Zur Ergänzung unseres Teams Maschinentechnik suchen wir Vollzeit (40,1 Std./Woche) zum nächstmöglichen Termin eine/n Ingenieur M.Sc. (m/w/d) Fachrichtung Verfahrenstechnik / Anlagenbau / Umwelttechnik / Nukleartechnik o.ä.
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Nachricht | 23.10.2020 | |
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Sekretär/in & Teamassistenz (m/w/d) in Teilzeit (40%)
Der Lehrstuhl für energieeffizientes und nachhaltiges Planen und Bauen der TU München sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt, unbefristet, in Teilzeit (40%) eine Teamassistenz (m/w/d)
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Nachricht | 12.07.2022 | |
| Prüfung - Internetrecht | Termin | 17.11.2009 | |
| Ausstellung: Die Kunst der Holzkonstruktion - Chinesische Architekturmodelle | Termin | 24.11.2009 | |
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Assessment Management (40,1h)
Die TUM School of Management der Technischen Universität München sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt auf zwei Jahre befristet, eine/n Vollzeit- bzw. zwei Teilzeitmitarbeiter/innen für den Aufgabenbereich Assessment Management (40,1h).
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Nachricht | 11.05.2017 | |
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Coordinator Community Building Smart City (international) (m/w)
UnternehmerTUM, das Zentrum für Innovation und Gründung an der TU München, begleitet internationale Start-ups und etablierte Unternehmen bei der Entwicklung neuer Produkte und Dienstleistungen, beim erfolgreichen Geschäftsaufbau, beim Markteintritt und in der Wachstumsphase. Das Accelerator-Programm TechFounders bereitet innovative Technologie-Start-ups innerhalb von 20 Wochen mithilfe von intensivem Coaching und Mentoring auf eine erste Risikokapitalrunde vor und bahnt mit Partnern aus der Industrie strategische Kooperationen an. Die Hightech-Werkstatt der UnternehmerTUM – MakerSpace – bietet auf 1.500 Quadratmetern einen einzigartigen Maschinenpark für den Prototypenbau und die Kleinserienfertigung. Der UnternehmerTUM-Fonds bietet Kapital für junge Technologieunter-nehmen mit internationalem Marktpotential. Mit jährlich mehr als 50 wachstumsstarken Technologie-Gründungen nimmt UnternehmerTUM eine führende Rolle in Europa ein.
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Nachricht | 11.05.2017 | |
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Program Manager (m/w, 40,1 h)
Die TUM School of Management der Technischen Universität München sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt – im Rahmen einer Mutterschutz- und Elternzeitvertretung – eine/n Vollzeit- bzw. zwei Teilzeit Program Manager (m/w, 40,1 h).
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Nachricht | 12.05.2017 | |
| Need a Single Room Apartment in Munich Long Term | Nachricht | 14.05.2017 | |
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¡communicate! Executive Training: Change Communication - Veränderungen erfolgreich managen
"Veränderung ist das, was die Leute am meisten fürchten." (Fjodor Dostojewskij)
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Termin | 22.01.2009 | |
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Mehrwert von Energiespeichern aus System- und Akteurssicht
Energiewirtschaftliches Seminar am Lehrstuhl für Energiewirtschaft und Anwendungstechnik
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Termin | 08.04.2016 | |
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Wissenschaftliche Hilfskraft (m/w/d) für Forschungsaufgaben im Umfeld der Digitalen Transformation der TUM
Das IT-Servicezentrum sucht Verstärkung durch eine wissenschaftliche Hilfskraft (m/w/d) für Forschungsaufgaben im Umfeld der Digitalen Transformation der TUM
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Nachricht | 15.09.2020 | |
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Studentische Hilfskraft (4-6 Stunden/Woche) im Servicebüro Studium der Informatik
Das Servicebüro Studium der Fakultät für Informatik der TUM sucht zur Unterstützung eine Studentische Hilfskraft (4-6 Std./Woche). Beginn ist ab Oktober 2021 möglich.
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Nachricht | 26.08.2021 | |
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2nd TUM Spring School on Systems Engineering
Im Frühjahr 2011 findet zum zweiten Mal die „TUM Spring School on Systems Engineering“ in Kooperation mit dem Stevens Institute of Technology statt. Die Spring School wendet sich an Doktoranden aller Fachbereiche, deren Promotionsthema Aspekte des Systems Engineering beinhaltet.
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Termin | 24.11.2010 | |
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Studentische/n Mitarbeiter/in im Seminar-/Eventmanagement für unsere Executive MBA Programme
Das Executive Education Center (EEC) der TUM School of Management der Technischen Universität München bie-tet unterschiedlichste Weiterbildungsformate an. Die große Bandbreite der Angebote spricht alle weiterbildungsaffi-nen Berufstätigen, vom Young Professional bis zur erfahrenen Führungskraft, an.
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Nachricht | 19.03.2020 | |
| Surface-enhanced Raman Scattering for Bioanalytics | Termin | 18.03.2009 | |
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Navigation vom MyTUM-Portal
Wir haben die Navigation vom MyTUM-Portal neu gegliedert. Finden Sie etwas nicht mehr oder haben Fragen, Anregungen? Schreiben Sie uns bitte: it-support@tum.de.
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Nachricht | 18.02.2016 | |
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Das Hochschulreferat für Forschungsförderung und Technologietransfer (TUM ForTe) sucht zum nächstmöglichen Zeitpunkt eine Wissenschaftliche Hilfskraft (20 Std./Woche, flexibel einzuteilen)
Aus der Grundlagenforschung der TUM erfolgt in vielen Bereichen der Schritt zur anwendungsorientierten Forschung, häufig in Kooperationen mit Unternehmen. Die Interessen der Erfinder werden dabei durch Schutzrechte und Patente gewahrt. TUM ForTe – Office for Research and Innovation – berät Wissenschaftlerinnen und Wissenschaftler professionell und umfassend zur Forschungsförderung und zum Technologietransfer insbesondere zu den Themen Erfindungen, deren Verwertung und Patent- und Lizenzangelegenheiten. Für die Unterstützung von TUM ForTe Patente und Lizenzen suchen wir zum nächstmöglichen Zeitpunkt (idealerweise zum 15. April 2016) eine motivierte und engagierte wissenschaftliche Hilfskraft.
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Nachricht | 23.02.2016 | |
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Mitarbeiter (m/w/d) als Büroassistenz
Als Büroassistenz im Centrum Baustoffe und Materialprüfung ist zum nächstmöglichen Zeitpunkt ein Mitarbeiter (m/w/d) in Vollzeit (Teilzeit nach Abstimmung möglich) gesucht.
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Nachricht | 02.07.2024 | |
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Studentische Hilfskräfte / Tutor
Wissenschaftliche Hilfskraft (Tutor) für die Übung „Allgemeinen Mikrobiologie“am Lehrstuhl für Mikrobielle Ökologie gesucht
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Nachricht | 29.06.2015 |


